Ugandas president Yoweri Museveni har sittet siden 1986. Parlamentet har 303 medlemmer hvorav 86 er nominert av ulike interessegrupper som kvinneorganisasjoner og militære. De øvrige medlemmene velges hvert femte år når det er parlamentsvalg. I perioden 1986-2005 var politiske partier underlagt restriksjoner, og kunne blant annet ikke gjennomføre valgkamp eller stille med kandindater til parlamentsvalg. En grunnlovsavstemning i juli 2005 opphevet forbudet og et reelt flerpartisystem ble innført.

Museveni vant valget i februar 2006 mot flere andre kandidater, deriblant Kizza Besigye. Selv om valget teknisk sett ble gjennomført på demokratisk vis, rapporterte opposisjonen om at aktivister og støttespillere under valgkampen ble fengslet og voldtatt. Kandidaten Besigye ble i tillegg beskyldt for lovbrudd og korrupsjon. Museveni har i løpet av sin periode som president blitt beskyldt for omfattende korrupsjon og underslag av offentlige midler.

26. august 2006 signerte LRA og ugandiske myndigheter en avtale om våpenhvile etter forhandlinger i Juba i Sør-Sudan. Fredssamtalene pågår fortsatt nesten ett år senere, så håpet om en varig løsning på konflikten er fortsatt til stede.